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MASS ARRAY 基因分型服務

 更新時間:2019-02-21 點擊量:2452

質譜法基因分型技術簡介

DNA質譜陣列基因分析系統(tǒng)以其通量高、自動化、靈活、結果準確、實驗成本低廉等諸多優(yōu)勢成為了大學、醫(yī)學生物學研究所、生物技術公司、制藥企業(yè)、疾控中心等機構所推崇的研究工具。應用領域涵蓋醫(yī)學及轉化醫(yī)學、分子生物學、基因組學、表觀遺傳學、農業(yè)遺傳育種及轉基因技術等相關領域。

檢測儀器信息

Sequenom MassArray時間飛行質譜生物芯片系統(tǒng)是為基因組學研究提供兼顧靈敏度和特異服務的中高通量技術平臺,廣泛地應用于遺傳突變檢測、SNP分型以及DNA甲基化定量分析研究,是目前唯yi采用質譜法進行直接檢測的設備。

Sequenom MassArray系統(tǒng)反應體系為非雜交依賴性,不需要各種標記物,實驗設計靈活,更可實現(xiàn)高達40重反應,是目前市場上擁有高性價比的產品。

Sequenom MassArray特定SNP位點檢測服務采用專業(yè)的引物設計和基因分型軟件,可對95%以上已被證實的SNP進行實驗設計,特別適合于SNP位點小于200個,樣本量大于500份的項目。實驗過程無需熒光標記,大大降低每次基因型分析的成本。


 

檢測原理
Sequenom MassARRAY® 分子量陣列技術是Sequenom 公司推出的世界上的基因分析工具,通過引物延伸或切割反應與靈敏、可靠的MALDI-TOF質譜技術相結合,經過PCR擴增,SAP酶處理, 延伸引物單堿基延伸,樹脂除鹽純化, 芯片點樣, 質譜檢測等實驗步驟,終使用Typer4.0 軟件分析實驗數(shù)據(jù),獲得基因分型結果。 
具體原理:Sequenom MassArray系統(tǒng)主要是利用基質輔助激光解吸電離飛行時間質譜 (MALDI-TOF MS) 進行分析,即PCR擴增產物或者預處理樣本在延伸單堿基后,將制備的樣品分析物與芯片基質共結晶,將該晶體放入質譜儀的真空管,而后用瞬時納秒 (10-9s) 強激光激發(fā),由于基質分子經輻射所吸收的能量,導致能量蓄積并迅速產熱,從而使基質晶體升華,核酸分子就會解吸附并轉變?yōu)閬喎€(wěn)態(tài)離子,產生的離子多為單電荷離子,這些單電荷      離子在加速電場中獲得相同的動能,進而在一非電場漂移區(qū)內按照其質荷比率得以分離,在真空小管中飛行到達檢測器。 
檢測應用 
中高通量SNP基因型分析
GWAS及二代測序驗證
腫瘤體細胞基因突變譜分析
基因表達定量及目標基因CNV分析
DNA甲基化定位定量
病原體分子分型
技術優(yōu)勢
定制靈活:可以自由選擇感興趣的SNP位點一張芯片上,樣本的數(shù)量和位置可以自由選擇一張芯片上,樣本和SNP位點的配對可以自由選擇。
分析準確:直接檢測待測物分子量,準確度超過99.7%。質譜技術靈活檢測PCR實驗失敗或三等位基因的存在??芍貜托愿撸總€樣品將要檢測到SNP位點適合精細定位和芯片實驗的后續(xù)研究。
高通量檢測:一張芯片上可完成384個樣品的多重iPLEX GOLD實驗;每個反應孔高可實現(xiàn)多達40重反應;每天可進行高達十萬次基因型分析。
檢測服務流程
1、客戶提供DNA或者生物樣本,并需要檢測SNP位點(rs編號) 
2、設計引物(包括PCR擴增引物和單堿基延伸引物) 
3、樣本制備PCR擴增、SAP處理、單堿基延伸 
4、點樣制備檢測用芯片陣列 
5、MALDI-TOF質譜檢測 
6、數(shù)據(jù)分析、給出分型報告 

樣本要求 
基因組DNA: 總量大于10 ng(視檢測位點數(shù)量遞增) 
A260/280在1.8-2.0 
A260/230大于1.8 
服務流程 
1、提交項目課題相關需求和資料。 
2、與我們的專業(yè)技術團隊討論項目細節(jié)。 
3、根據(jù)討論后的意見對實驗方案進行修改。 
4、雙方均滿意并達成一致,簽訂技術服務合同。 
5、開展實驗,按期完成合同規(guī)定的內容。 
6、結題,提供實驗原始結果和分析結果、實驗流程、實驗條件等等。 
咨詢與訂購 
感謝您選擇我們的服務,如果您有任何問題,請聯(lián)系我們,我們將竭誠為您解答和服務。 

 

 

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